1、将种瓜于11月下旬采收后放在5℃～7℃的地方。可以把整个瓜保存在缸内或沙藏于温暖之处，四周覆盖煤灰，上再覆稻草等，保暖防冻过冬。
2、催芽时间于第二年1月下旬 将种瓜取出，用塑料袋逐个包好，移到暖室或热炕上催芽， 温度15～20℃。催芽温度不宜太高．温度过高出芽快， 但芽细不健壮。
3、隔离留种佛手瓜为雌雄同株异花授粉植物，留种栽培时应注意将品种（品系）进行隔离。常采用的方法有地区隔离法和人工套袋隔离法。
4、地区隔离法大规模留种时，品种间种植距离至少相隔1000米，如有高山等天然隔离屏障，则可缩短至500米左右。
5、人工隔离法少量留种时，可在雌雄花开放前1～2天，分别套上纸袋，或用保险丝、小塑料夹夹住花瓣，授粉时将刚开放的雄花花粉涂在雌花的柱头上。
6、随即套回纸袋或夹住花瓣，不让昆虫传粉。人工辅助授粉宜在上午6：00～8：00进行。
7、种瓜采收种瓜必须达到生理成熟期才可采收，即果皮由绿色变淡黄色，或由白色变淡黄白色，皮面光滑、变硬，有刺种刺瘤刚硬，手摸有刺感。